Vào đầu những năm 1990, Tưởng Vĩ Quốc đã thành lập Ủy ban Di dời linh cữu không chính thức (奉安移靈小組) để kiến ​​nghị với chính phủ Cộng sản cho phép cha nuôi Tưởng Giới Thạch và anh trai Tưởng Kinh Quốc được đưa về Trung Quốc đại lục.[19] Yêu cầu của ông bị cả Chính phủ Quốc dân và Cộng sản phớt lờ, và ông đã bị người vợ góa của cha minh Tống Mỹ Linh thuyết phục từ bỏ đơn thỉnh cầu vào tháng 11 năm 1996.

Vào năm 1991, người giúp việc nhà của Tưởng, Lý Hồng Mỹ được tìm thấy đã chết trong khu nhà của Tưởng ở Đài Bắc. Cuộc điều tra sau đó của cảnh sát đã phát hiện ra một kho dự trữ sáu mươi khẩu súng trong điền trang của Tưởng. Bản thân Tưởng cũng thừa nhận khả năng có mối liên hệ giữa những khẩu súng và cái chết của người giúp việc, sau đó được cảnh sát phán quyết là một vụ tự sát.[19] Vụ việc đã vĩnh viễn làm hoen ố tên tuổi của Tưởng Vĩ Quốc, vào thời điểm mà gia đình họ Tưởng ngày càng không được lòng nhân dân Đài Loan và ngay cả trong Quốc dân đảng.

Năm 1993, Tưởng Vĩ Quốc được bổ nhiệm làm cố vấn cấp cao cho Tổng thống Lý Đăng Huy bất chấp sự đối địch chính trị trước đó của họ.

Năm 1994, một bệnh viện được cho là được đặt theo tên ông (蔣緯國醫療中心) ở Tam Trì, huyện Đài Bắc (nay là thành phố Tân Bắc), sau khi một chính trị gia giấu tên quyên góp cho Tập đoàn tài chính Ruentex (潤泰企業集團), có người sáng lập đến từ Tam Trì. Các chính trị gia đã đặt câu hỏi về động cơ.[19]

Năm 1996, ngôi nhà của Tưởng trên đất quân sự cuối cùng đã bị phá bỏ theo lệnh của chính quyền thành phố Đài Bắc dưới quyền Trần Thủy Biển. Khu đất được xây dựng vào năm 1971. Sau khi Tưởng chuyển đi nơi khác vào năm 1981, ông đã sang nhượng nó cho con trai mình. Lời biện minh là con trai ông không phải tham gia nghĩa vụ quân sự và do đó không được quyền sống ở đó. [20]

Tưởng Vĩ Quốc qua đời ở tuổi 80, vào ngày 22 tháng 9 năm 1997, vì suy thận. Ông đã bị tụt huyết áp phức tạp do bệnh tiểu đường sau 10 tháng điều trị tại Bệnh viện đa khoa cựu chiến binh Đài Bắc. Ông mong muốn được chôn cất tại Tô Châu ở đại lục nhưng thay vào đó được chôn cất tại Nghĩa trang Quân đội Núi Ngô Chí.